Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ebf1Q07802 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ebf1Q07802 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ebf1Q07802 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ebf1Q07802 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ebf1Q07802 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ebf1Q07802 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms