Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cab39Q06138 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cab39Q06138 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cab39Q06138 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cab39Q06138 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cab39Q06138 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cab39Q06138 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms