Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
PtprgQ05909 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35,08■■■■□ 3,21
PtprgQ05909 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
PtprgQ05909 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35,07■■■■□ 3,21
PtprgQ05909 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
PtprgQ05909 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
PtprgQ05909 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
PtprgQ05909 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
PtprgQ05909 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
PtprgQ05909 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35,03■■■■□ 3,2
PtprgQ05909 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
PtprgQ05909 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35,02■■■■□ 3,2
PtprgQ05909 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
PtprgQ05909 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
PtprgQ05909 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3,19
PtprgQ05909 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
PtprgQ05909 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
PtprgQ05909 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
PtprgQ05909 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
PtprgQ05909 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
PtprgQ05909 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
PtprgQ05909 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
PtprgQ05909 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
PtprgQ05909 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34,95■■■■□ 3,19
PtprgQ05909 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,92■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,9■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,9■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34,9■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,89■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34,89■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
PtprgQ05909 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34,88■■■■□ 3,17
PtprgQ05909 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
PtprgQ05909 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
PtprgQ05909 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34,87■■■■□ 3,17
PtprgQ05909 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,87■■■■□ 3,17
PtprgQ05909 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34,86■■■■□ 3,17
PtprgQ05909 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34,85■■■■□ 3,17
PtprgQ05909 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34,85■■■■□ 3,17
PtprgQ05909 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34,84■■■■□ 3,17
PtprgQ05909 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
PtprgQ05909 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34,81■■■■□ 3,16
PtprgQ05909 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34,81■■■■□ 3,16
PtprgQ05909 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
PtprgQ05909 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,8■■■■□ 3,16
PtprgQ05909 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34,79■■■■□ 3,16
PtprgQ05909 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
PtprgQ05909 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
PtprgQ05909 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
PtprgQ05909 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34,74■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34,71■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34,7■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
PtprgQ05909 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
PtprgQ05909 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,68■■■■□ 3,14
PtprgQ05909 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
PtprgQ05909 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
PtprgQ05909 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,66■■■■□ 3,14
PtprgQ05909 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34,66■■■■□ 3,14
PtprgQ05909 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,66■■■■□ 3,14
PtprgQ05909 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34,65■■■■□ 3,14
PtprgQ05909 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,64■■■■□ 3,14
PtprgQ05909 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
PtprgQ05909 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
PtprgQ05909 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
PtprgQ05909 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
PtprgQ05909 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34,59■■■■□ 3,13
PtprgQ05909 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34,59■■■■□ 3,13
PtprgQ05909 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34,59■■■■□ 3,13
PtprgQ05909 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,57■■■■□ 3,13
PtprgQ05909 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
PtprgQ05909 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
PtprgQ05909 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
PtprgQ05909 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
PtprgQ05909 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
PtprgQ05909 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34,54■■■■□ 3,12
PtprgQ05909 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,54■■■■□ 3,12
PtprgQ05909 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34,52■■■■□ 3,12
PtprgQ05909 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
PtprgQ05909 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34,51■■■■□ 3,12
PtprgQ05909 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
PtprgQ05909 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
PtprgQ05909 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
PtprgQ05909 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34,49■■■■□ 3,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,1 ms