Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Col9a1Q05722 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Col9a1Q05722 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Col9a1Q05722 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24,53■■□□□ 1,52
Col9a1Q05722 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Col9a1Q05722 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Col9a1Q05722 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Col9a1Q05722 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Col9a1Q05722 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Col9a1Q05722 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Col9a1Q05722 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Col9a1Q05722 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Col9a1Q05722 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Col9a1Q05722 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Col9a1Q05722 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Col9a1Q05722 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,42■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,4■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Col9a1Q05722 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24,37■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24,35■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Col9a1Q05722 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Col9a1Q05722 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
Col9a1Q05722 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24,16■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Col9a1Q05722 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,8 ms