Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC31,97■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC31,96■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31,95■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC31,95■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31,95■■■□□ 2,71
Cacna1sQ02789 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Cacna1sQ02789 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Cacna1sQ02789 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC31,92■■■□□ 2,7
Cacna1sQ02789 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC31,92■■■□□ 2,7
Cacna1sQ02789 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Cacna1sQ02789 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Cacna1sQ02789 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Cacna1sQ02789 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Cacna1sQ02789 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Cacna1sQ02789 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Cacna1sQ02789 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Cacna1sQ02789 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Cacna1sQ02789 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Cacna1sQ02789 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Cacna1sQ02789 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Cacna1sQ02789 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Cacna1sQ02789 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Cacna1sQ02789 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Cacna1sQ02789 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Cacna1sQ02789 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Cacna1sQ02789 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,82■■■□□ 2,69
Cacna1sQ02789 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC31,81■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC31,77■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC31,77■■■□□ 2,68
Cacna1sQ02789 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Cacna1sQ02789 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31,76■■■□□ 2,67
Cacna1sQ02789 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Cacna1sQ02789 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Cacna1sQ02789 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Cacna1sQ02789 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Cacna1sQ02789 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Cacna1sQ02789 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Cacna1sQ02789 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Cacna1sQ02789 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
Cacna1sQ02789 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
Cacna1sQ02789 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
Cacna1sQ02789 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,7■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC31,68■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC31,67■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Cacna1sQ02789 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Cacna1sQ02789 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31,62■■■□□ 2,65
Cacna1sQ02789 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Cacna1sQ02789 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Cacna1sQ02789 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Cacna1sQ02789 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Cacna1sQ02789 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31,6■■■□□ 2,65
Cacna1sQ02789 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31,59■■■□□ 2,65
Cacna1sQ02789 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Cacna1sQ02789 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,57■■■□□ 2,64
Cacna1sQ02789 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Cacna1sQ02789 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Cacna1sQ02789 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Cacna1sQ02789 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Cacna1sQ02789 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Cacna1sQ02789 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Cacna1sQ02789 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Cacna1sQ02789 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Cacna1sQ02789 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Cacna1sQ02789 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,2 ms