Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SeboxP70368 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SeboxP70368 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SeboxP70368 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeboxP70368 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SeboxP70368 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SeboxP70368 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SeboxP70368 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SeboxP70368 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SeboxP70368 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.4 ms