Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ube2kP61087 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ube2kP61087 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2kP61087 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ube2kP61087 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2kP61087 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ube2kP61087 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2kP61087 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2kP61087 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2kP61087 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2kP61087 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2kP61087 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2kP61087 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2kP61087 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2kP61087 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2kP61087 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2kP61087 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2kP61087 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms