Protein–RNA interactions for Protein: P60882

Megf8, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 2,789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Megf8P60882 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Megf8P60882 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Megf8P60882 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Megf8P60882 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Megf8P60882 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Megf8P60882 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Megf8P60882 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Megf8P60882 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Megf8P60882 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Megf8P60882 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Megf8P60882 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Megf8P60882 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Megf8P60882 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Megf8P60882 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Megf8P60882 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Megf8P60882 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Megf8P60882 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Megf8P60882 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms