Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cd38P56528 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd38P56528 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd38P56528 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cd38P56528 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd38P56528 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd38P56528 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cd38P56528 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd38P56528 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cd38P56528 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd38P56528 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd38P56528 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd38P56528 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cd38P56528 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cd38P56528 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd38P56528 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cd38P56528 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cd38P56528 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd38P56528 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cd38P56528 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd38P56528 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cd38P56528 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cd38P56528 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cd38P56528 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms