Protein–RNA interactions for Protein: P54763

Ephb2, Ephrin type-B receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb2P54763 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb2P54763 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb2P54763 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ephb2P54763 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ephb2P54763 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb2P54763 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ephb2P54763 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms