Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RabggtbP53612 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RabggtbP53612 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RabggtbP53612 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RabggtbP53612 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RabggtbP53612 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RabggtbP53612 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RabggtbP53612 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RabggtbP53612 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RabggtbP53612 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RabggtbP53612 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RabggtbP53612 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RabggtbP53612 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RabggtbP53612 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RabggtbP53612 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RabggtbP53612 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RabggtbP53612 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RabggtbP53612 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RabggtbP53612 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RabggtbP53612 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RabggtbP53612 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RabggtbP53612 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RabggtbP53612 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RabggtbP53612 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RabggtbP53612 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RabggtbP53612 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RabggtbP53612 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RabggtbP53612 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RabggtbP53612 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RabggtbP53612 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RabggtbP53612 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RabggtbP53612 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RabggtbP53612 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RabggtbP53612 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RabggtbP53612 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RabggtbP53612 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RabggtbP53612 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RabggtbP53612 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RabggtbP53612 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RabggtbP53612 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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