Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccr1P51675 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccr1P51675 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccr1P51675 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccr1P51675 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccr1P51675 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccr1P51675 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccr1P51675 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccr1P51675 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccr1P51675 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccr1P51675 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccr1P51675 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccr1P51675 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccr1P51675 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccr1P51675 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccr1P51675 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccr1P51675 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccr1P51675 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccr1P51675 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccr1P51675 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccr1P51675 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccr1P51675 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccr1P51675 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccr1P51675 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccr1P51675 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccr1P51675 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccr1P51675 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccr1P51675 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccr1P51675 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccr1P51675 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccr1P51675 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccr1P51675 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccr1P51675 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccr1P51675 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccr1P51675 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccr1P51675 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccr1P51675 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccr1P51675 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccr1P51675 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccr1P51675 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccr1P51675 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccr1P51675 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccr1P51675 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccr1P51675 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccr1P51675 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccr1P51675 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccr1P51675 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccr1P51675 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccr1P51675 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccr1P51675 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccr1P51675 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccr1P51675 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccr1P51675 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccr1P51675 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccr1P51675 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms