Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf10P50592 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf10P50592 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf10P50592 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf10P50592 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf10P50592 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf10P50592 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf10P50592 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf10P50592 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf10P50592 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf10P50592 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf10P50592 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf10P50592 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfsf10P50592 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnfsf10P50592 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnfsf10P50592 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnfsf10P50592 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfsf10P50592 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfsf10P50592 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfsf10P50592 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfsf10P50592 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms