Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hcls1P49710 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hcls1P49710 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hcls1P49710 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hcls1P49710 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hcls1P49710 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms