Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
InaP46660 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
InaP46660 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
InaP46660 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
InaP46660 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
InaP46660 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
InaP46660 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
InaP46660 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
InaP46660 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
InaP46660 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
InaP46660 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
InaP46660 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
InaP46660 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
InaP46660 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
InaP46660 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
InaP46660 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
InaP46660 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
InaP46660 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
InaP46660 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
InaP46660 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
InaP46660 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
InaP46660 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
InaP46660 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
InaP46660 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
InaP46660 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
InaP46660 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
InaP46660 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
InaP46660 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
InaP46660 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
InaP46660 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
InaP46660 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
InaP46660 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
InaP46660 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
InaP46660 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
InaP46660 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
InaP46660 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
InaP46660 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
InaP46660 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
InaP46660 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
InaP46660 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
InaP46660 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
InaP46660 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
InaP46660 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
InaP46660 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
InaP46660 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
InaP46660 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
InaP46660 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
InaP46660 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
InaP46660 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
InaP46660 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
InaP46660 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
InaP46660 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
InaP46660 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
InaP46660 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
InaP46660 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
InaP46660 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
InaP46660 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
InaP46660 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
InaP46660 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
InaP46660 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
InaP46660 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
InaP46660 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
InaP46660 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
InaP46660 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
InaP46660 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
InaP46660 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
InaP46660 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
InaP46660 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
InaP46660 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
InaP46660 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
InaP46660 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
InaP46660 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
InaP46660 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
InaP46660 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
InaP46660 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
InaP46660 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
InaP46660 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
InaP46660 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
InaP46660 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
InaP46660 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
InaP46660 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
InaP46660 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
InaP46660 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
InaP46660 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
InaP46660 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
InaP46660 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
InaP46660 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
InaP46660 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
InaP46660 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
InaP46660 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
InaP46660 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
InaP46660 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
InaP46660 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
InaP46660 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
InaP46660 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
InaP46660 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
InaP46660 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
InaP46660 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
InaP46660 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
InaP46660 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms