Protein–RNA interactions for Protein: P38532

Hsf1, Heat shock factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf1P38532 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hsf1P38532 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hsf1P38532 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hsf1P38532 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hsf1P38532 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hsf1P38532 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hsf1P38532 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hsf1P38532 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hsf1P38532 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hsf1P38532 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hsf1P38532 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hsf1P38532 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hsf1P38532 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hsf1P38532 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hsf1P38532 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hsf1P38532 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hsf1P38532 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hsf1P38532 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hsf1P38532 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hsf1P38532 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hsf1P38532 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms