Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VimP20152 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VimP20152 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VimP20152 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VimP20152 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VimP20152 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VimP20152 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VimP20152 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VimP20152 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VimP20152 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VimP20152 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VimP20152 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VimP20152 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VimP20152 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VimP20152 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VimP20152 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VimP20152 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VimP20152 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VimP20152 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VimP20152 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VimP20152 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VimP20152 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VimP20152 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VimP20152 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VimP20152 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VimP20152 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VimP20152 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VimP20152 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VimP20152 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VimP20152 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VimP20152 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VimP20152 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VimP20152 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VimP20152 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VimP20152 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VimP20152 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VimP20152 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VimP20152 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VimP20152 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VimP20152 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VimP20152 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VimP20152 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VimP20152 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VimP20152 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VimP20152 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VimP20152 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VimP20152 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VimP20152 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VimP20152 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VimP20152 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VimP20152 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VimP20152 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VimP20152 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VimP20152 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VimP20152 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VimP20152 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VimP20152 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VimP20152 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VimP20152 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VimP20152 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VimP20152 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VimP20152 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VimP20152 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VimP20152 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VimP20152 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VimP20152 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VimP20152 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VimP20152 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VimP20152 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VimP20152 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VimP20152 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VimP20152 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VimP20152 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VimP20152 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VimP20152 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VimP20152 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VimP20152 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VimP20152 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VimP20152 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VimP20152 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VimP20152 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VimP20152 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VimP20152 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VimP20152 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VimP20152 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VimP20152 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VimP20152 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VimP20152 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VimP20152 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VimP20152 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VimP20152 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VimP20152 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VimP20152 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VimP20152 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VimP20152 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VimP20152 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VimP20152 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VimP20152 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VimP20152 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VimP20152 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms