Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ca3P16015 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ca3P16015 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ca3P16015 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ca3P16015 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ca3P16015 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ca3P16015 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ca3P16015 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ca3P16015 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ca3P16015 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ca3P16015 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ca3P16015 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ca3P16015 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ca3P16015 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ca3P16015 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ca3P16015 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ca3P16015 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ca3P16015 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ca3P16015 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ca3P16015 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ca3P16015 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ca3P16015 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ca3P16015 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ca3P16015 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ca3P16015 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ca3P16015 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ca3P16015 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ca3P16015 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ca3P16015 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ca3P16015 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ca3P16015 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ca3P16015 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ca3P16015 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ca3P16015 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ca3P16015 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ca3P16015 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms