Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Tnp1P10856 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Tnp1P10856 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms