Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01757 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01757 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01757 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01757 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01757 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01757 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01757 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01757 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01757 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
P01757 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01757 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01757 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P01757 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01757 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01757 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01757 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01757 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01757 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01757 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P01757 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01757 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01757 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01757 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P01757 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01757 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01757 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P01757 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01757 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P01757 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01757 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01757 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01757 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01757 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P01757 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
P01757 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01757 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01757 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01757 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P01757 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01757 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01757 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01757 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01757 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P01757 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01757 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01757 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01757 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01757 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P01757 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01757 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01757 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01757 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01757 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01757 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01757 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P01757 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01757 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01757 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01757 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01757 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P01757 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01757 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01757 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01757 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P01757 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P01757 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01757 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01757 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P01757 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01757 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01757 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01757 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
P01757 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01757 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P01757 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01757 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01757 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01757 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P01757 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01757 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01757 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01757 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01757 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P01757 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P01757 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01757 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P01757 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01757 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01757 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P01757 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01757 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01757 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01757 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01757 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01757 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01757 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01757 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01757 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01757 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms