Protein–RNA interactions for Protein: O88855

Ltb4r, Leukotriene B4 receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb4rO88855 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ltb4rO88855 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltb4rO88855 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ltb4rO88855 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ltb4rO88855 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ltb4rO88855 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltb4rO88855 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltb4rO88855 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ltb4rO88855 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ltb4rO88855 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ltb4rO88855 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ltb4rO88855 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ltb4rO88855 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ltb4rO88855 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ltb4rO88855 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ltb4rO88855 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ltb4rO88855 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ltb4rO88855 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ltb4rO88855 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ltb4rO88855 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ltb4rO88855 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms