Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IlkO55222 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IlkO55222 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IlkO55222 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IlkO55222 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IlkO55222 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IlkO55222 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IlkO55222 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IlkO55222 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IlkO55222 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IlkO55222 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IlkO55222 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IlkO55222 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IlkO55222 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IlkO55222 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IlkO55222 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IlkO55222 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IlkO55222 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IlkO55222 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IlkO55222 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IlkO55222 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IlkO55222 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IlkO55222 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IlkO55222 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IlkO55222 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IlkO55222 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IlkO55222 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IlkO55222 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IlkO55222 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IlkO55222 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IlkO55222 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IlkO55222 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IlkO55222 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IlkO55222 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IlkO55222 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IlkO55222 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IlkO55222 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IlkO55222 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IlkO55222 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IlkO55222 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IlkO55222 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IlkO55222 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IlkO55222 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IlkO55222 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IlkO55222 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IlkO55222 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IlkO55222 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IlkO55222 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IlkO55222 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IlkO55222 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IlkO55222 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IlkO55222 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IlkO55222 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IlkO55222 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IlkO55222 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IlkO55222 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IlkO55222 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IlkO55222 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IlkO55222 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IlkO55222 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IlkO55222 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IlkO55222 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IlkO55222 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IlkO55222 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IlkO55222 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IlkO55222 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IlkO55222 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IlkO55222 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IlkO55222 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IlkO55222 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IlkO55222 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IlkO55222 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IlkO55222 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IlkO55222 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IlkO55222 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IlkO55222 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IlkO55222 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IlkO55222 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IlkO55222 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IlkO55222 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IlkO55222 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IlkO55222 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IlkO55222 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IlkO55222 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IlkO55222 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IlkO55222 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IlkO55222 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IlkO55222 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IlkO55222 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IlkO55222 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IlkO55222 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IlkO55222 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IlkO55222 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IlkO55222 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IlkO55222 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IlkO55222 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IlkO55222 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IlkO55222 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IlkO55222 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IlkO55222 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms