Protein–RNA interactions for Protein: O55091

Impact, Protein IMPACT, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ImpactO55091 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ImpactO55091 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ImpactO55091 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ImpactO55091 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ImpactO55091 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ImpactO55091 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ImpactO55091 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ImpactO55091 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ImpactO55091 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ImpactO55091 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ImpactO55091 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ImpactO55091 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ImpactO55091 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ImpactO55091 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ImpactO55091 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ImpactO55091 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ImpactO55091 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ImpactO55091 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ImpactO55091 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ImpactO55091 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ImpactO55091 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ImpactO55091 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ImpactO55091 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ImpactO55091 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ImpactO55091 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ImpactO55091 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ImpactO55091 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ImpactO55091 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ImpactO55091 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ImpactO55091 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ImpactO55091 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ImpactO55091 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ImpactO55091 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ImpactO55091 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms