Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Bnc1O35914 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bnc1O35914 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bnc1O35914 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bnc1O35914 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnc1O35914 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bnc1O35914 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Bnc1O35914 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms