Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Phox2bO35690 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phox2bO35690 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Phox2bO35690 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phox2bO35690 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phox2bO35690 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phox2bO35690 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phox2bO35690 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phox2bO35690 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phox2bO35690 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phox2bO35690 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phox2bO35690 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phox2bO35690 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phox2bO35690 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phox2bO35690 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phox2bO35690 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phox2bO35690 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Phox2bO35690 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phox2bO35690 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Phox2bO35690 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms