Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc23O35125 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc23O35125 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc23O35125 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc23O35125 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc23O35125 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc23O35125 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms