Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ArxO35085 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ArxO35085 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ArxO35085 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ArxO35085 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ArxO35085 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ArxO35085 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ArxO35085 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ArxO35085 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ArxO35085 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ArxO35085 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ArxO35085 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ArxO35085 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ArxO35085 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ArxO35085 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ArxO35085 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ArxO35085 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ArxO35085 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ArxO35085 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ArxO35085 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ArxO35085 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ArxO35085 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ArxO35085 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ArxO35085 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ArxO35085 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ArxO35085 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ArxO35085 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ArxO35085 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ArxO35085 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ArxO35085 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ArxO35085 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ArxO35085 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ArxO35085 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ArxO35085 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ArxO35085 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ArxO35085 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ArxO35085 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ArxO35085 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ArxO35085 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ArxO35085 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ArxO35085 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ArxO35085 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ArxO35085 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ArxO35085 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ArxO35085 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ArxO35085 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ArxO35085 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ArxO35085 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ArxO35085 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ArxO35085 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ArxO35085 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ArxO35085 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ArxO35085 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ArxO35085 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ArxO35085 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ArxO35085 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ArxO35085 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ArxO35085 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ArxO35085 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ArxO35085 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ArxO35085 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ArxO35085 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ArxO35085 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ArxO35085 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ArxO35085 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ArxO35085 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ArxO35085 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ArxO35085 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ArxO35085 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ArxO35085 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ArxO35085 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ArxO35085 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ArxO35085 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ArxO35085 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ArxO35085 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ArxO35085 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ArxO35085 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ArxO35085 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ArxO35085 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ArxO35085 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ArxO35085 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ArxO35085 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ArxO35085 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ArxO35085 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ArxO35085 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ArxO35085 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ArxO35085 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ArxO35085 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ArxO35085 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ArxO35085 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ArxO35085 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ArxO35085 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ArxO35085 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ArxO35085 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ArxO35085 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ArxO35085 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ArxO35085 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ArxO35085 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ArxO35085 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ArxO35085 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms