Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ88

Gm5145, Predicted pseudogene 5145, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5145F8VQ88 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5145F8VQ88 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5145F8VQ88 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm5145F8VQ88 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5145F8VQ88 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5145F8VQ88 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5145F8VQ88 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5145F8VQ88 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5145F8VQ88 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5145F8VQ88 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5145F8VQ88 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5145F8VQ88 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5145F8VQ88 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5145F8VQ88 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5145F8VQ88 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5145F8VQ88 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5145F8VQ88 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5145F8VQ88 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms