Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5218F6YH22 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5218F6YH22 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm5218F6YH22 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm5218F6YH22 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms