Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn2r40F6W043 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn2r40F6W043 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r40F6W043 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn2r40F6W043 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vmn2r40F6W043 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r40F6W043 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r40F6W043 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r40F6W043 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn2r40F6W043 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r40F6W043 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r40F6W043 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn2r40F6W043 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r40F6W043 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn2r40F6W043 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn2r40F6W043 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms