Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28305F6U473 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28305F6U473 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm28305F6U473 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28305F6U473 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms