Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
BC005561E9Q5E2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
BC005561E9Q5E2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
BC005561E9Q5E2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
BC005561E9Q5E2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
BC005561E9Q5E2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
BC005561E9Q5E2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
BC005561E9Q5E2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
BC005561E9Q5E2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
BC005561E9Q5E2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
BC005561E9Q5E2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
BC005561E9Q5E2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
BC005561E9Q5E2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
BC005561E9Q5E2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
BC005561E9Q5E2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
BC005561E9Q5E2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
BC005561E9Q5E2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
BC005561E9Q5E2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
BC005561E9Q5E2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
BC005561E9Q5E2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
BC005561E9Q5E2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
BC005561E9Q5E2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
BC005561E9Q5E2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
BC005561E9Q5E2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
BC005561E9Q5E2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
BC005561E9Q5E2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
BC005561E9Q5E2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
BC005561E9Q5E2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
BC005561E9Q5E2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
BC005561E9Q5E2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
BC005561E9Q5E2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
BC005561E9Q5E2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
BC005561E9Q5E2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
BC005561E9Q5E2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
BC005561E9Q5E2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
BC005561E9Q5E2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
BC005561E9Q5E2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
BC005561E9Q5E2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
BC005561E9Q5E2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
BC005561E9Q5E2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
BC005561E9Q5E2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BC005561E9Q5E2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
BC005561E9Q5E2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BC005561E9Q5E2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BC005561E9Q5E2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BC005561E9Q5E2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BC005561E9Q5E2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BC005561E9Q5E2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BC005561E9Q5E2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BC005561E9Q5E2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
BC005561E9Q5E2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
BC005561E9Q5E2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
BC005561E9Q5E2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
BC005561E9Q5E2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
BC005561E9Q5E2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
BC005561E9Q5E2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
BC005561E9Q5E2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
BC005561E9Q5E2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
BC005561E9Q5E2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
BC005561E9Q5E2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
BC005561E9Q5E2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
BC005561E9Q5E2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
BC005561E9Q5E2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
BC005561E9Q5E2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
BC005561E9Q5E2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
BC005561E9Q5E2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
BC005561E9Q5E2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
BC005561E9Q5E2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms