Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
NebE9Q1W3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NebE9Q1W3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NebE9Q1W3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms