Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otud3B1AZ99 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otud3B1AZ99 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Otud3B1AZ99 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Otud3B1AZ99 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud3B1AZ99 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms