Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34c4A2ANA3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34c4A2ANA3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cldn34c4A2ANA3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn34c4A2ANA3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn34c4A2ANA3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms