Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Frmpd1A2AKB4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Frmpd1A2AKB4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Frmpd1A2AKB4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Frmpd1A2AKB4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Frmpd1A2AKB4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
Frmpd1A2AKB4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Frmpd1A2AKB4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
Frmpd1A2AKB4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Frmpd1A2AKB4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Frmpd1A2AKB4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Frmpd1A2AKB4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
Frmpd1A2AKB4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Frmpd1A2AKB4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Frmpd1A2AKB4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Frmpd1A2AKB4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
Frmpd1A2AKB4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Frmpd1A2AKB4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC42.67■■■■■ 4.42
Frmpd1A2AKB4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Frmpd1A2AKB4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Frmpd1A2AKB4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Frmpd1A2AKB4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Frmpd1A2AKB4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
Frmpd1A2AKB4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC42.63■■■■■ 4.42
Frmpd1A2AKB4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC42.63■■■■■ 4.42
Frmpd1A2AKB4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Frmpd1A2AKB4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
Frmpd1A2AKB4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Frmpd1A2AKB4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Frmpd1A2AKB4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
Frmpd1A2AKB4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Frmpd1A2AKB4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Frmpd1A2AKB4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Frmpd1A2AKB4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Frmpd1A2AKB4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Frmpd1A2AKB4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Frmpd1A2AKB4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Frmpd1A2AKB4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Frmpd1A2AKB4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Frmpd1A2AKB4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC42.51■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Frmpd1A2AKB4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Frmpd1A2AKB4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
Frmpd1A2AKB4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Frmpd1A2AKB4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Frmpd1A2AKB4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
Frmpd1A2AKB4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Frmpd1A2AKB4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Frmpd1A2AKB4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Frmpd1A2AKB4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Frmpd1A2AKB4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Frmpd1A2AKB4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Frmpd1A2AKB4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Frmpd1A2AKB4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Frmpd1A2AKB4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Frmpd1A2AKB4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Frmpd1A2AKB4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Frmpd1A2AKB4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
Frmpd1A2AKB4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Frmpd1A2AKB4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Frmpd1A2AKB4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Frmpd1A2AKB4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Frmpd1A2AKB4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
Frmpd1A2AKB4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Frmpd1A2AKB4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Frmpd1A2AKB4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Frmpd1A2AKB4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
Frmpd1A2AKB4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Frmpd1A2AKB4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Frmpd1A2AKB4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Frmpd1A2AKB4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Frmpd1A2AKB4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Frmpd1A2AKB4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms