Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rpusd2Q149F1 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms