Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 DLG5-AS1-201ENST00000449852 487 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
HDAC11Q96DB2 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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