Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Napg-201ENSMUST00000025474 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm22672-201ENSMUST00000104414 134 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Lrrc66-201ENSMUST00000087177 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm3702-201ENSMUST00000211754 346 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd11P23813 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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