Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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Limd1Q9QXD8 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Limd1Q9QXD8 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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