Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Prdm6Q3UZD5 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Prdm6Q3UZD5 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Prdm6Q3UZD5 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Prdm6Q3UZD5 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Prdm6Q3UZD5 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Prdm6Q3UZD5 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Prdm6Q3UZD5 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Prdm6Q3UZD5 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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