Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Col5a3Q9JLI2 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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Col5a3Q9JLI2 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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