Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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