Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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Rabgef1Q9JM13 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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Rabgef1Q9JM13 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Rabgef1Q9JM13 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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Rabgef1Q9JM13 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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