Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtpreP49446 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtpreP49446 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms