Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxd9P28357 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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