Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc166S4R181 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms