Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcniQ9Z2V9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CcniQ9Z2V9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms