Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hdac6Q9Z2V5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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