Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mtmr1Q9Z2C4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mtmr1Q9Z2C4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms